Villa dell'Agata si trova nelle Marche, in provincia di Pesaro e Urbino, nel comune di Sant'Angelo in Vado, a breve distanza dalla rinascimentale città di Urbino e dai confini con l'Umbria e la Toscana.

È all'altitudine di 550 metri, in posizione panoramica sulle colline circostanti, in vista del non lontano Monte Nerone.

Nel raggio di meno di 20 chilometri in linea d'aria si trovano, oltre ad Urbino, località storiche di notevole interesse artistico e ambientale come Sant'Angelo in Vado, Mercatello sul Metauro, Urbania, Piobbico e Sassocorvaro.

Proveniendo dall'Adriatico

Per chi percorre l'autostrada adriatica A14 Bologna - Taranto, l'uscita consigliata è il casello di Fano (PU). Prendere la superstrada E 78 verso Roma. Superata Fossombrone, prendere la direzione di Urbino, girando successivamente verso Fermignano e Urbania e proseguendo per Sant'Angelo in Vado.

Qui giunti, girare attorno al paese, fino ad incontrare sulla destra, immediatamente prima del ponte sul Metauro, l'indicazione per Villa dell'Agata. Proseguire seguendo i cartelli stradali esattamente per 4,8 chilometri.

Proveniendo dall'interno

Proveniendo da Roma, ma anche dall'Umbria e dalla Toscana, e percorrendo la superstrada E45 (Ravenna - Orte), uscire a San Giustino (PG) e dirigersi verso Urbino fino a raggiungere Sant'Angelo in Vado.

Qui giunti, immediatamente dopo il ponte sul Metauro, sulla sinistra, vedrete l'indicazione per Villa dell'Agata. Proseguire seguendo i cartelli stradali esattamente per 4,8 chilometri.